TY - JOUR T1 - Comparative genomics reveals insights into avian genome evolution and adaptation JF - Science Y1 - 2014 A1 - Zhang, G. J. A1 - Li, C. A1 - Li, Q. Y. A1 - Li, B. A1 - Larkin, D. M. A1 - Lee, C. A1 - Storz, J. F. A1 - Antunes, A. A1 - Greenwold, M. J. A1 - Meredith, R. W. A1 - Odeen, A. A1 - Cui, J. A1 - Zhou, Q. A1 - Xu, L. H. A1 - Pan, H. L. A1 - Wang, Z. J. A1 - Jin, L. J. A1 - Zhang, P. A1 - Hu, H. F. A1 - Yang, W. A1 - Hu, J. A1 - Xiao, J. A1 - Yang, Z. K. A1 - Liu, Y. A1 - Xie, Q. L. A1 - Yu, H. A1 - Lian, J. M. A1 - Wen, P. A1 - Zhang, F. A1 - Li, H. A1 - Zeng, Y. L. A1 - Xiong, Z. J. A1 - Liu, S. P. A1 - Zhou, L. A1 - Huang, Z. Y. A1 - An, N. A1 - J. Wang A1 - Zheng, Q. M. A1 - Xiong, Y. Q. A1 - Wang, G. B. A1 - Wang, B. A1 - Wang, J. J. A1 - Fan, Y. A1 - da Fonseca, R. R. A1 - Alfaro-Nunez, A. A1 - Schubert, M. A1 - Orlando, L. A1 - Mourier, T. A1 - Howard, J. T. A1 - Ganapathy, G. A1 - Pfenning, A. A1 - Whitney, O. A1 - Rivas, M. V. A1 - Hara, E. A1 - Smith, J. A1 - Farre, M. A1 - Narayan, J. A1 - Slavov, G. A1 - Romanov, M. N. A1 - Borges, R. A1 - Machado, J. P. A1 - Khan, I. A1 - Springer, M. S. A1 - Gatesy, J. A1 - Hoffmann, F. G. A1 - Opazo, J. C. A1 - Hastad, O. A1 - Sawyer, R. H. A1 - Kim, H. A1 - Kim, K. W. A1 - Kim, H. J. A1 - Cho, S. A1 - Li, N. A1 - Huang, Y. H. A1 - Bruford, M. W. A1 - Zhan, X. J. A1 - Dixon, A. A1 - Bertelsen, M. F. A1 - Derryberry, E. A1 - Warren, W. A1 - Wilson, R. K. A1 - Li, S. B. A1 - Ray, D. A. A1 - Green, R. E. A1 - O'Brien, S. J. A1 - Griffin, D. A1 - Johnson, W. E. A1 - Haussler, D. A1 - Ryder, O. A. A1 - Willerslev, E. A1 - Graves, G. R. A1 - Alstrom, P. A1 - Fjeldsa, J. A1 - Mindell, D. P. A1 - Edwards, S. V. A1 - Braun, E. L. A1 - Rahbek, C. A1 - Burt, D. W. A1 - Houde, P. A1 - Zhang, Y. A1 - Yang, H. M. A1 - J. Wang A1 - Jarvis, E. D. A1 - Gilbert, M. T. P. A1 - J. Wang A1 - Avian Genome Consortium KW - Birds KW - diversity KW - functional diversification KW - Gene Duplication KW - intron size KW - Mammals KW - mutation-rate KW - rapid evolution KW - transposable elements KW - vertebrate AB -

Birds are the most species-rich class of tetrapod vertebrates and have wide relevance across many research fields. We explored bird macroevolution using full genomes from 48 avian species representing all major extant clades. The avian genome is principally characterized by its constrained size, which predominantly arose because of lineage-specific erosion of repetitive elements, large segmental deletions, and gene loss. Avian genomes furthermore show a remarkably high degree of evolutionary stasis at the levels of nucleotide sequence, gene synteny, and chromosomal structure. Despite this pattern of conservation, we detected many non-neutral evolutionary changes in protein-coding genes and noncoding regions. These analyses reveal that pan-avian genomic diversity covaries with adaptations to different lifestyles and convergent evolution of traits.

VL - 346 SN - 0036-8075 N1 -

Aw3maTimes Cited:9Cited References Count:90

ER -